L'origine du château de Bouchout remonte au 12èS. Au cours des siècle, il a subi des dégradations et des restaurations. En 1849 il devient la propriété de Léopold II qui y installe sa soeur, Charlotte, veuve de Maximilien de Habsbourg, ex empereur du Mexique.
En 1938, l'État belge achète le domaine de Bouchout en vue d'y créer ce qui deviendra en 1958 le Jardin botanique national de Belgique d'une surface de 92ha.